1、常規測序

　　常規測序：采用ABI 3730XL測序儀進行測序，有效讀長可達800bp以上/反應

　　樣品要求：基因組DNA、PCR擴增產物、菌液、質粒DNA等

　　結果形式：電子郵件發送序列文件

　　完成周期：24-48小時

　　2、二代測序技術服務

　　1)基因組de novo測序：用于獲得物種的全基因組序列圖譜，同時為后續研究提供參考序列。

　　實驗要求：

　　1、客戶需提供待測樣本及相關信息(組織樣品，質量不少于10g;提取的基因組DNA：產量≥100mg，濃度≥50ng/ul;OD260/280值介于1.8～2.0之間;確保DNA無降解，無污染。DNA可分步提供)。

　　2、客戶應提供相應的背景材料，包括：樣本描述，預測基因組大小，分析要求等。

　　結果形式：

　　提供項目實驗報告和分析報告：實驗報告包括簡單的操作流程、試劑使用等情況;分析報告包括：基因組survey、組裝結果、基因結構分析、重復序列分析、基因功能分析、比較基因組學分析、非編碼RNA分析。

　　完成周期：根據基因組復雜程度而定。

　　2)基因組重測序：用于在全基因組范圍內進行變異檢測(Indel，SNP)、進行群體進化分析、進行遺傳圖譜構建。

　　實驗要求：

　　1、客戶需提供待測樣本及相關信息(組織樣品，質量不少于5g;提取的基因組DNA：產量≥20ug，濃度≥50ng/ul;OD260/280值介于1.8～2.0之間;確保DNA無降解，無污染。)。

　　2、客戶應提供相應的背景材料，包括：樣本描述，實驗目的，必要的相關實驗設計內容，分析要求等。

　　結果形式：

　　提供項目實驗報告和分析報告：實驗報告包括簡單的操作流程、試劑使用等情況;分析報告包括：數據產出統計和評估、Mapping情況統計、SNP/INdel Calling分析、nsSNP-containing基因定位和功能注釋、相近物種進化分析等。

　　完成周期：質檢合格后40個工作日內完成。

　　3)轉錄組測序：用于基因表達差異分析(質和量)、發掘新基因、進行RNA編輯分析。

　　實驗要求：

　　1、客戶需提供待測樣本及相關信息(組織樣品，質量不少于5g;提取的總RNA：產量≥10ug，濃度≥50ng/ul;OD260/280值介于1.8～2.0之間;確保RNA無降解，無污染。)。

　　2、客戶應提供相應的背景材料，包括：樣本描述，實驗目的，必要的相關實驗設計內容，分析要求等。

　　結果形式：

　　提供項目實驗報告和分析報告：實驗報告包括簡單的操作流程、試劑使用等情況;分析報告包括：對于有參考基因組序列的轉錄組分析包括：數據產出統計和評估、基因表達差異分析、差異表達基因GO富集分析、KEGG分析、SNP/Indel篩選、新基因查找、剪切位點統計、蛋白網絡互作等。對于無參考基因組序列的轉錄組分析包括：數據產出統計和評估、de novo組裝結果、污染檢測、基因表達及差異分析、差異表達基因GO富集分析、KEGG分析、基因互作網絡分析、新轉錄本查找與LncRNA預測。

　　完成周期：質檢合格后40個工作日內完成(如果增加分析要求，時間順延)。

　　4)Small RNA測序：用于miRNA表達模式分析、miRNA調控網絡和靶點、發掘生物標記物。

　　實驗要求：

　　1、客戶需提供待測樣本及相關信息(組織樣品，質量不少于5g;提取的總RNA：產量≥50ug，濃度≥50ng/ul;OD260/280值介于1.8～2.0之間;小RNA：產量≥20ug，濃度≥200ng/ul;OD260/280值介于1.8～2.0之間;確保RNA無降解，無污染。)。

　　2、客戶應提供相應的背景材料，包括：樣本描述，實驗目的，必要的相關實驗設計內容，分析要求等。

　　結果形式：

　　提供項目實驗報告和分析報告：實驗報告包括簡單的操作流程、試劑使用等情況;分析報告包括：數據質控、參考序列比對、小RNA分類、rRNA，tRNA，snRNA，repeat sRNA和snoRNA鑒定、靶基因預測、堿基偏好性分析、差異表達分析、GO富集分析、KEGG分析、蛋白互作網絡分析。

　　完成周期：質檢合格后40個工作日內完成(如果增加分析要求，時間順延)。

　　5)全外顯子組測序：用于經濟高效發掘外顯子區的致病位點及易感位點，發現稀有突變。

　　實驗要求：

　　1、客戶需提供待測樣本及相關信息(組織樣品，質量不少于5g;提取的基因組DNA：產量≥50ug，濃度≥50ng/ul;OD260/280值介于1.8～2.0之間;確保DNA無降解，無污染。)。

　　2、客戶應提供相應的背景材料，包括：樣本描述，實驗目的，必要的相關實驗設計內容，分析要求等。

　　結果形式：

　　提供項目實驗報告和分析報告：實驗報告包括簡單的操作流程、試劑使用等情況;分析報告包括：數據質控、與參考序列進行比對、統計測序深度及覆蓋度、SNP/Indel檢測、注釋及統計、Somatic SNP/Indel檢測、注釋及統計。

　　完成周期：質檢合格后40個工作日內完成(如果增加分析要求，時間順延)。

　　6)甲基化測序：用于獲得單堿基精確度的全基因組DNA甲基化圖譜。

　　實驗要求：

　　1、客戶需提供待測樣本及相關信息(DNA樣品總量≥5ug，DNA樣品濃度≥150ng/ul)。

　　2、客戶應提供相應的背景材料，包括：樣本描述，實驗目的，必要的相關實驗設計內容，分析要求等。

　　結果形式：

　　提供項目實驗報告和分析報告：實驗報告包括簡單的操作流程、試劑使用等情況;分析報告包括：數據質控、參考序列比對、C位點覆蓋度統計、全基因組甲基化水平分析、甲基化位點檢測、差異甲基化區域分析、比對率統計、測序深度統計、染色體水平甲基化密度分布、不同基因組功能元件甲基化分布、CpG、CHG、CHH甲基化比例統計、功能注釋及富集分析等。

　　完成周期：質檢合格后40個工作日內完成(如果增加分析要求，時間順延)。